EZ3kiel a eu deux vies. La première, de 1993 à 1997, à cinq, à l'issue de laquelle Brigitte au chant et Florent à la guitare quittent le groupe pour des raisons artistiques. Leur son rock fusion musclé va alors devenir plus électronique.
Le trio composé de Johann Guillon (machines), Matthieu Fays (batterie) et Yann Nguema (basse) entame un virage instrumental et expérimental. Ce changement va vite payer puisque leur premier six titres, Equalize It, publié à la fin de l'année 1998 leur ouvre, malgré des ventes restreintes, les portes des Transmusicales de Rennes et du Printemps de Bourges.
Un véritable tremplin puisque les trois Tourangeaux sont alors signés sur le label lyonnais Jarring Effects qu'ils ne quitteront plus. Leur premier album voit le jour en 2001 avec notamment la participation de Yann Tiersen. Handle With Care oscille doucement entre dub et électronique avec déjà une volonté de s'affranchir des frontières stylistiques classiques.
Il permet aussi à Yann Nguame de développer son talent de graphiste. L'univers graphique fait d'images rétro-futuristes et sombres qu'il créé devient tout de suite une part de l'identité d'EZ3kiel. Une dimension transposée sur scène. Avec Barb4ry en 2003, leur style s'affine, les morceaux sont plus aboutis et leur univers visuel et sonore s'affirme.
Leur affiliation au dub vient surtout des bases rythmiques, mais leur goût du travail des textures, des ambiances rugueuses et percutantes les rapproche de la musique électronique downtempo. Passages énergiques et organiques se succèdent avec réussite.
La période suivant la sortie de ce disque sera presque entièrement consacrée à une grande tournée française conclue, début 2005, par un DVD et un album intitulé Versus Tour enregistré en concert avec les invités de Barb4ry dont le groupe belge DAAU. S'y trouve une puissante reprise du thème du film Requiem for a Dream et un aperçu des visuels projetés sur scène.
L'alliance de l'image à la musique se prolongera sur le projet interactif Naphtaline qui voit le jour en 2007. Un disque accompagné d'un DVD-Rom qui présente à nouveau toute l'étendue des talents artistiques du groupe. Leur son se fait alors plus doux et apaisant. Déjà présent sur cet album, le multi-instrumentiste Stéphane Badiaud intègre véritablement le groupe en 2007.
Il arrive pour l'enregistrement de Battlefield qui sortira dans l'urgence l'année suivante. Leur musique prend un tournant plus rock, mélange d'électrique et d'électronique toujours majoritairement instrumental. EZ3kiel repart pour une grande tournée qui passera par plusieurs festivals français d'envergure, même si leur musique reste encore assez confidentielle. Collision Tour en 2009 retrace la tournée commune entre EZ3kiel et les Angevins de Hint. EZ3kiel donne en juin 2011 une série de concerts où il reprend le répertoire de Naphtaline, qui n'avait pas fait l'objet d'une tournée lors de sa sortie. Baptisé The Naphtaline Orchestra le résultat fait l'objet d'un CD/DVD en octobre 2012.
Toujours en 2012, EZ3kiel entreprend la tournée EZ3kiel Extended avec l'apport de Sylvain Joubert (basse), Cyril Soufflet (piano), Gérald Bouvet (guitare), Erick Pigeard (percussions), Thomas Quinart (saxophone), Bertrand Margelidon (trompette, bugle),Simon Dupire (trombone), Pierre Malle, Anthony Chéneauet Ombeline Collin (violons) et Benjamin Garnier (violoncelle). De cette nouvelle expérience musicale, naît en 2013 l'album Extended Vinyl disponible uniquement en support vinyle. Sylvain Joubert remplace Yann Nguéma au sein d'EZ3kiel qui sort LUX en novembre 2014.